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Parasites & Vecteurs volume 16, Numéro d'article : 117 (2023) Citer cet article

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La majorité de la population africaine vit dans des zones rurales où elle dépend fortement de la production agricole et animale pour sa subsistance. Compte tenu de leur importance socio-économique, nous avons lancé une étude de surveillance standardisée multi-pays (Bénin, Burkina Faso, Ghana, Nigéria, Éthiopie, Tanzanie et Ouganda) pour évaluer l'état actuel des hémoparasites importants transmis par les tiques (TBHP) du bétail.

Nous avons évalué les prévalences d'agents pathogènes (Anaplasma marginale, Anaplasma centrale, Babesia bigemina, Babesia bovis, Ehrlichia ruminantium et Theileria parva) dans le sang de 6447 animaux répartis dans quatorze districts (deux districts par pays). De plus, nous avons recherché des facteurs de risque intrinsèques (sexe, poids, condition physique) et extrinsèques (élevage, exposition aux tiques) comme prédicteurs d'infections par les TBHP.

Une grande variation macro-géographique a été observée dans les prévalences d'A. marginale, B. bigemina, B. bovis et E. ruminantium. La plupart étaient corrélés à la cooccurrence de leurs ensembles spécifiques de tiques vecteur-compétentes. Les nombres les plus élevés de bovins infectés ont été trouvés au Ghana et au Bénin, et les plus faibles au Burkina Faso. Alors que T. parva a été rarement trouvé (Ouganda uniquement : 3,0 %), A. marginale a été trouvé dans chaque pays avec une prévalence d'au moins 40 %. Les individus infectés par Babesia bovis avaient des scores d'état corporel inférieurs. L'âge (tel qu'estimé via le poids corporel) était plus élevé chez les bovins infectés par A. marginale, mais était négativement corrélé avec les prévalences de B. bigemina et E. ruminantium. L'infection à Ehrlichia ruminantium était plus souvent retrouvée chez les mâles, et A. marginale plus souvent dans les élevages de transhumance. Des niveaux élevés de co-infection, en particulier la combinaison A. marginale × B. bigemina, ont été observés dans tous les pays, à l'exception de l'Ouganda et du Burkina Faso. Babesia bigemina a été plus ou moins souvent observée que prévu par hasard, lorsque les bovins étaient également co-infectés respectivement par E. ruminantium ou A. marginale.

Les agents pathogènes du bétail transmis par les tiques sont omniprésents dans les systèmes de production bovine des petits exploitants africains. Notre étude standardisée aidera un large éventail de parties prenantes à fournir des recommandations pour la surveillance et la prévention du TBHP chez les bovins, en particulier pour B. bovis qui impacte fortement la production et continue sa propagation sur le continent africain via la tique invasive Rhipicephalus microplus.

La plupart des populations africaines vivent dans des zones rurales où elles dépendent fortement de la production agricole et animale pour leur subsistance [1]. Une grande partie des agriculteurs subsahariens appartiennent à des communautés agricoles aux ressources limitées et luttent pour maintenir un niveau de vie minimal, souvent en raison de la présence de maladies infectieuses et vectorielles du bétail. Pour augmenter la productivité, la rentabilité et la durabilité de l'élevage, des intrants abordables améliorant le rendement sont nécessaires. Ici, le contrôle des parasites est d'une importance primordiale, pour laquelle des enquêtes standardisées sur l'état actuel des hémoparasites transmis par les tiques (TBHP) sont essentielles. Dans un monde en constante évolution, dans lequel les moteurs anthropiques de l'urbanisation et du changement climatique affectent l'habitat et le risque d'exposition aux parasites, des enquêtes à jour sont essentielles pour fournir aux institutions africaines (privées et gouvernementales) des opportunités d'interagir, de collaborer et d'améliorer renforcement des capacités mutuelles pour le contrôle des parasites. De plus, ces données de base permettent d'identifier et de mesurer les changements effectifs dans la présence et le fardeau des tiques et des maladies transmises par les tiques. En outre, en raison du manque de diagnostics standardisés et abordables dans de nombreux pays africains, il est loin d'être possible d'estimer le fardeau et le risque réels des parasites transmis par les tiques et leurs dommages économiques associés.

Dans le cadre d'un projet de cartographie parasitaire axé sur l'amélioration des soins du bétail en Afrique, nous avons lancé une étude de surveillance standardisée dans plusieurs pays pour évaluer l'état actuel des TBHP endémiques importants chez les bovins dans sept territoires d'Afrique subsaharienne (Afrique de l'Ouest : Burkina Faso, Ghana, Bénin, Nigéria et Afrique de l'Est : Éthiopie, Ouganda, Tanzanie) [2, 3]. Grâce à la création d'un réseau vétérinaire durable pour l'Afrique, nous avons simultanément échantillonné des nombres représentatifs de bovins à travers les pays à l'échelle macro-géographique (niveau du district) pour les dépistages moléculaires de TBHP, tout en tenant compte de l'échelle micro-géographique (fermes au sein du district) et individuelle (bovins). au sein de l'exploitation) variation de la prévalence du TBHP, et ce sur une fenêtre temporelle d'environ un an. La variation spatio-temporelle des microparasites pathogènes suivants d'importance socio-économique [4] a été étudiée : (1) Ehrlichia ruminantium, l'agent causal de la cowdriose, est une bactérie intracellulaire obligatoire qui envahit les cellules endothéliales des bovins, ovins, caprins et ruminants sauvages avec une issue souvent mortelle. Des stratégies de contrôle et de prévention contre la cowdriose ont été développées, mais avec une efficacité limitée. Les tiques Amblyomma sont considérées comme les principaux vecteurs [5]. (2) Anaplasma marginale, l'agent étiologique de l'anaplasmose bovine, est l'agent pathogène transmis par les tiques le plus répandu chez les bovins et est transmis, souvent mécaniquement, par une grande variété d'espèces de tiques. Les tabanidés et les mouches des écuries sont également impliqués dans ses cycles de transmission. C'est un agent pathogène intra-érythrocytaire qui provoque des symptômes de maladie aiguë : anémie, perte de poids et souvent la mort. Une infection à A. marginale persistante tout au long de la vie chez les animaux qui survivent à l'anaplasmose, qui sont souvent cliniquement sains, sert de réservoirs pour la transmission d'A. marginale [6]. (3) Une deuxième espèce moins pathogène, l'A. centrale intraérythrocytaire, provoque des infections bénignes, et est souvent utilisée comme souche vaccinale contre l'A. marginale plus virulent [6]. Dans les régions subtropicales du monde, la babésiose bovine est causée par des parasites protozoaires intra-érythrocytaires, notamment (4) B. bovis et (5) B. bigemina [7]. Les symptômes d'infection par différents Babesia spp. sont similaires, mais B. bovis est plus virulent que les autres piroplasmes. Babesia bigemina est plus répandue et plus commune en Afrique que B. bovis, probablement en raison d'un plus large éventail d'espèces de tiques Rhipicephalus capables de vecteurs. (6) La fièvre de la côte orientale (Theileria parva) appartient au même ordre que les Babesidae, mais présente un type de pathologie différent, car elle peut également infecter les globules blancs et endothéliaux [8]. Theileria parva est transmise principalement par R. appendiculatus et provoque une maladie mortelle chez les animaux sensibles et en particulier les veaux [4, 9, 10].

La prévalence du TBHP dépend d'une présence multiforme et de l'abondance de plusieurs hôtes sensibles dans un habitat approprié pour les tiques, ainsi que des vecteurs de tiques compétents eux-mêmes. La mise en œuvre de mesures efficaces pour contrôler les maladies à transmission vectorielle (c'est-à-dire l'établissement de stratégies de traitement et de prévention appropriées) repose sur l'élucidation de ces dynamiques locales de transmission des agents pathogènes, qui incluent le niveau de sensibilité et d'infectiosité des organismes qui transportent et transmettent les agents pathogènes (c'est-à-dire le réservoir hôtes et ectoparasites capables de vecteurs) et les taux de contact entre les vecteurs (infectés) et les hôtes [11,12,13]. Ici, pour inspirer les plans d'intervention actuels et futurs, outre une surveillance transversale actualisée du TBHP, nous avons exploré les associations entre le statut infectieux de l'animal et les caractéristiques intrinsèques ainsi que les cooccurrences de tiques et de TBHP. En résumé, dans cet article, les questions suivantes sont abordées : (1) Dans quelle mesure les TBHP varient-ils macro-géographiquement ?, (2) Quelles caractéristiques de l'hôte (sexe, condition physique et poids corporel comme approximation de l'âge) sont associées au TBHP prévalence ?, (3) Après avoir pris en compte la contribution des tiques vecteur-compétentes connues, existe-t-il d'autres suspects de tiques vecteur-compétentes qui expliquent une variation supplémentaire de la présence d'agents pathogènes ?, (4) Certaines combinaisons d'agents pathogènes se produisent-elles plus souvent que prévu de manière aléatoire par chance au niveau individuel ?

Les sept pays inclus dans l'étude étaient limités à ceux priorisés en Afrique subsaharienne par la stratégie de développement agricole originale de la Fondation Bill & Melinda Gates, et étaient considérés comme donnant une bonne représentation des TBHP bovins d'Afrique de l'Est et de l'Ouest. Dans chaque pays, deux districts (Fig. 1) ont été sélectionnés avec une forte densité de bétail connue, donc avec une prévalence élevée attendue de tiques et de maladies transmises par les tiques. Deux sites échantillonnés sont localisés dans le Sud-Ouest du Burkina Faso : Sarkandiala dans la province de La Léraba et Bekuy dans la province du Houet. Ghana : Akuse et Narh Korkpe sont tous deux situés dans le district de Lower Manya Krobo. Les deux communautés sont situées autour des rives sud du lac Volta. Bénin : Djougou, N'dali, Ouassa Pehunco, Bassila et Ouaké appartiennent au département de la Donga ; Abomey, Djidja, Ouinhi, Zangnannando et Zogbodomey, appartiennent au département du Zou. Le district de Manya Krobo se situe à environ 80-85 km à l'est d'Accra, la capitale du Ghana. Ce district fait partie de la zone de savane côtière des plaines d'Accra, avec un régime pluviométrique bimodal. Nigéria : État du Plateau (Quanpam, Shandam et Wase) et État de Kaduna (Zaria). Éthiopie : sites typiques représentatifs du centre et de l'est d'Oromia ; Ada'a est situé dans les hautes terres centrales de l'Éthiopie à environ 2300 m, tandis que Boset est situé dans les basses terres de l'Éthiopie à une altitude de 947 m au-dessus du niveau de la mer. Ouganda : district de Serere , bordé par les districts de Soroti et Kaberamaido au nord, le district de Ngora à l'est, les districts de Pallisa, Kaliro et Buyende au sud. Le district est composé de deux comtés ruraux (Kasilo et Serere) et de huit sous-comtés (Bugondo, Kadungulu, Pingire, Labour, Atiira, Kateta, Chere et Serere/Olio) contenant 254 villages propriétaires de bétail. Tanzanie : Chamakweza dans le district de Bagamoyo (région côtière) et Madibila (district de Mbarali ; région de Mbeya située à une altitude de 1560 m au-dessus du niveau de la mer). Les sites d'échantillonnage se composaient de petits éleveurs de bétail (éleveurs de bétail à ressources limitées) avec des troupeaux de bovins principalement sédentaires situés dans les localités sélectionnées. L'enquête a été menée sur une période d'un an (août 2016 à juin 2017). Le travail de terrain a consisté en quatre visites d'échantillonnage quaternaire. La durée de l'échantillonnage individuel pour chaque visite (sur les deux sites) était d'environ deux semaines (environ 1 semaine par site), mais variait en fonction des défis logistiques rencontrés. Lors de chaque visite, l'objectif était d'échantillonner 240 bovins (environ 120 par site).

Vue d'ensemble des sites d'échantillonnage dans sept pays africains. Pour chacun des districts, la prévalence des individus infectés et co-infectés par le TBHP (voir légende) est représentée dans des graphiques en anneau (voir Fichier supplémentaire 1 : Tableau S2 pour une répartition plus détaillée des co-infections chez les bovins)

Le poids des bovins (échantillonnés pour les parasites provenant de petits troupeaux) a été estimé à l'aide d'une bande RONDO® (Kyron Labs, Johannesburg, Afrique du Sud) selon les recommandations du fabricant. La notation du conditionnement corporel a été effectuée pour ces animaux conformément aux instructions de travail fournies dans le protocole (voir Fichier supplémentaire 2 : Protocole). De plus, nous avons déterminé le sexe, le type d'élevage et le nombre de tiques vecteur-compétentes pour chacun des agents pathogènes (voir plus loin). La variation entre les fermes pour chacun des pays est présentée dans le tableau 1. Des échantillons de sang ont été prélevés pour le dépistage moléculaire des TBHP.

Des échantillons de sang total ont été prélevés par lacération de la veine de l'oreille moyenne de chaque animal échantillonné à l'aide d'aiguilles autopiqueuses de 22 G. Environ 125 μL de l'échantillon de sang ont été prélevés à partir des gouttes de sang qui se sont formées sur la veine de l'oreille lacérée à l'aide de tubes capillaires héparinés et appliqués sur des cartes Classic Flinders Technology Associates [FTA] (Whatman®). Les échantillons de sang ont été laissés sécher à l'air libre puis étiquetés en série. Par la suite, les échantillons de sang ont été emballés dans des sachets FTA avec un déshydratant de gel de silice (Sigma Aldrich, Co., Sciences de la vie, États-Unis) avant d'être expédiés à Clinvet international [Uitsig Road, Universitas, Bloemfontein, 9338, Afrique du Sud] pour analyse. Les sachets ont été étiquetés de manière appropriée afin que les échantillons puissent être retracés jusqu'au village, à la paroisse, au sous-comté, au comté, au district et au pays d'origine. Des données supplémentaires sur les éventuels prédicteurs intrinsèques et extrinsèques d'infection par différents TBHP ont été enregistrées sur un formulaire de saisie de données séparé qui accompagnait les échantillons à Clinvet international.

La technologie des cartes FTA a été utilisée pour expédier les échantillons de sang. Les cartes ont été perforées (poinçons de 3 × 5 mm de diamètre) et soumises à l'isolement de l'ADN. L'ADN a été isolé à partir de poinçons de 2 × 5 mm de diamètre à l'aide du kit MagMAX™ DNA Multi-Sample Ultra, conformément aux recommandations du fabricant. L'ADN a été isolé à partir de 92 échantillons par cycle, y compris les contrôles d'extraction pour chaque cycle à l'aide d'un instrument KingFisher 96-flex. L'ADN a été élué dans un volume final de 75 ul.

L'ADN synthétique (GeneArt, Allemagne) englobant les amplicons cibles de PCR pleine longueur a été cloné dans un plasmide et a servi de matrice de contrôle positif dans chaque cycle de PCR. Les séquences synthétiques d'amplicon pleine longueur étaient basées sur les données de séquence obtenues auprès de GenBank (fichier supplémentaire 1 : tableau S0). Les échantillons de contrôle négatifs contenaient de l'ADN génomique bovin pour exclure les signaux de détection dérivés de l'hôte. Le protocole ci-dessous est basé sur des amorces/sondes d'essais publiés [14,15,16,17]. Le mélange maître d'ADN polymérase SsoAdvanced Universal Probes Supermix (Bio-Rad) tolérant aux inhibiteurs et hautement processif a été utilisé dans tous les tests PCR. Les amorces et les sondes du test ont été évaluées dans un environnement cible unique et multiplex à l'aide de matrices d'ADN synthétique linéaire à séquence vérifiée pour déterminer la limite de détection (LOD) pour chaque test en présence de 10 ng d'ADN bovin. Les combinaisons finales de tests PCR multiplex étaient basées sur des résultats qui présentaient le même LOD dans les configurations PCR simple et multiplex. Le système robotique de manipulation de liquide Hamilton Nimbus a été utilisé pour l'ajout de mastermix et de matrice à une plaque PCR à 384 puits. Toutes les plaques contenaient les échantillons de contrôle positif pertinents (ADN synthétique représentant 100 copies de chaque région cible par réaction), le contrôle négatif (10 ng d'ADN bovin provenant d'un animal donneur Clinvet pour exclure l'amplification liée à l'hôte), le contrôle d'extraction (pour exclure l'amplification liée au kit d'extraction ). Un total de 5 µl d'ADN matrice a été utilisé dans une réaction PCR finale de 15 µl et a été soumis à un cycle thermique consistant en une dénaturation initiale à 98 °C pendant 3 min, suivie de 45 cycles de 95 °C pendant 15 s et 60 °C pendant 30 s en utilisant le système QuantStudio6 qPCR. Les données capturées pendant le cycle thermique ont été analysées à l'aide du logiciel PCR en temps réel QuantStudio v1.2. Le multiplex 1 a été effectué en premier pour s'assurer qu'aucune inhibition dérivée de la matrice n'a été observée (en utilisant l'IAC), puis suivi des 2 autres PCR. Les échantillons présentant les profils d'amplification corrects (forme et croisement Ct dans la limite de la plage de détection) ont été appelés « détectés », tandis que les autres ont été appelés « non détectés ».

En bref, l'échantillonnage de la moitié du corps a été effectué sur cinq sites de prédilection : (i) les pattes antérieures internes et externes, les pattes postérieures et l'abdomen ; (ii) queue et région anale; (iii) tête et cou; (iv) zone latérale et zone dorsale des épaules à la base de la queue ; et (v) les oreilles. Les tiques ont été retirées à l'aide de pinces. La collecte a été réalisée pendant environ 15 min au total à partir de tous les sites de prédilection. Pour les animaux fortement infestés, les tiques restant sur l'animal après la période de collecte de 15 minutes ont été comptées et enregistrées. Les différents genres ont été enregistrés séparément. Les tiques ont été identifiées en fonction de leur morphologie à l'aide d'un stéréoscope (grossissement 80 fois). Pour mieux visualiser la dentition de l'hypostome des tiques appartenant au sous-genre Rhipicephalus (Boophilus), un microscope (grossissement de 100 à 200 fois) a été utilisé. Seuls les spécimens adultes ont été identifiés au niveau de l'espèce en utilisant à la fois des descriptions taxonomiques [18] et des clés morphologiques [19, 20]. Les résultats sur la variation géographique des communautés de tiques et les charges au niveau des espèces de tiques seront publiés dans un article séparé (Heylen D. et Madder M. en préparation). Les vecteurs compétents les plus importants [18] sont répertoriés dans le fichier supplémentaire 1 : tableau S1, ainsi que d'autres espèces de tiques couramment trouvées. Par agent pathogène, pour chaque individu hôte, la somme du nombre de tiques vecteur-compétentes a été calculée. La variation entre les fermes des charges moyennes de tiques vecteur-compétentes est présentée dans le tableau 1.

Les données possèdent une structure hiérarchique avec des niveaux d'infection (0/1) pour chaque animal niché dans la ferme et la ferme nichée dans le district. Afin d'obtenir des inférences statistiques valides, la structure de dépendance des données devait être prise en compte. A ces fins, des modèles mixtes linéaires généralisés (GLMM) ont été ajustés sur les données [voir 21] en tenant compte de la dépendance statistique des observations au sein des exploitations (imbriquées dans les districts) en ajoutant des effets aléatoires à chacun des niveaux. On a supposé que les résidus pour les proportions d'agents pathogènes suivaient une distribution binomiale (lien logit). Pour les bovins échantillonnés (n = 7072), l'occurrence d'agents pathogènes a été incluse comme variables de réponse dans les modèles, avec les variables explicatives suivantes : les facteurs de risque intrinsèques (sexe, état corporel, poids corporel) et extrinsèques (élevage : communautaire vs. transhumance) ). De plus, nous avons inclus pour chaque individu la charge de tiques vecteur-compétentes. Pour chacune des variables explicatives continues (c'est-à-dire la charge de tiques, le poids corporel et le score d'état corporel), nous avons centré les données au niveau de la ferme et du district, en raison d'importantes variations géographiques (tableau 1). Ce faisant, les résultats ont permis de différencier à quel niveau (c'est-à-dire au niveau individuel, de la ferme, du district) et comment la variation de la prévalence des agents pathogènes était expliquée. Nous mettrons l'accent sur les associations trouvées aux niveaux inférieurs (c'est-à-dire l'individu et l'exploitation) car ceux-ci sont moins confondus par les biais écologiques. Nous considérons que la comparaison continentale généralisée entre les quatre visites est peu pertinente sur le plan épidémiologique, étant donné que pour chaque pays, la saisonnalité climatique diffère. Par conséquent, l'étude des différences entre les visites a été restreinte au sein du district, en ajoutant la variation macro-géographique temporelle comme effet aléatoire imbriqué au sein du district.

Pour toutes les analyses, une procédure de sélection descendante par étapes a été utilisée pour sélectionner le meilleur modèle. À chaque étape, nous avons exclu le facteur fixe avec la valeur P non significative la plus élevée (P > 0,05), réexécuté le modèle et examiné les valeurs P des facteurs fixes dans le modèle réduit. La réduction du modèle s'est poursuivie jusqu'à ce qu'il ne reste plus que des facteurs significatifs (P < 0,05) et leurs termes d'interaction d'ordre inférieur [22].

Dans une deuxième phase, les résidus de chaque modèle (c'est-à-dire les résidus qui restent après correction des facteurs de risque intrinsèques, extrinsèques ainsi que les tiques vecteur-compétentes connues) ont été utilisés pour répondre aux questions suivantes : (1) lequel des TBHP fait de manière non aléatoire coexistent au niveau individuel. Le package R HMSC (Hierarchical Model of Species Communities) [23] a été utilisé pour explorer les associations potentielles, en tenant compte de la structure imbriquée des effets aléatoires. Pour cela, un modèle probit aux données de présence/absence a assuré une convergence réussie, dont les distributions postérieures ont été échantillonnées (trois chaînes de Monte Carlo à chaîne de Markov, chacune avec 1500 échantillons, mince 1000 et transitoire 750 000). Les associations ont en outre été vérifiées en ajoutant l'un des agents pathogènes comme explication de l'autre dans les GLMM décrits ci-dessus. (2) quelles autres tiques peuvent être suspectées d'être des espèces supplémentaires capables de vecteurs pour un certain agent pathogène. Pour l'analyse statistique de ces derniers, nous avons avancé deux critères : (a) l'espèce de tique suspectée montre une corrélation limitée avec des vecteurs compétents connus, sinon la cooccurrence géographique/écologique entraînerait des associations potentielles avec les TBHP (rang de Spearman ρ entre la tique compétente et suspecte < 0,3) ; (b) il montre une association positive avec les TBHP, après la correction des effets des tiques vecteur-compétentes connues ; (c) on trouve en moyenne 0,5 tique sur l'animal (au niveau des districts) signifiant que la tique est suffisamment commune. Après application de ces critères de sélection, seules les deux espèces de Babesia ont pu évaluer la compétence vectorielle des tiques supplémentaires (Hyalomma rufipes, Rhipicephalus pulchellus, Rhipicephalus appendiculatus, Rhipicephalus evertsi evertsi). Pour Anaplasma et Ehrlichia ruminantium, tous les candidats vecteurs potentiels étaient corrélés avec les vraies tiques vecteur-compétentes (ρ > 0,3). Toute la gestion des données et les analyses statistiques ont été effectuées dans SAS v 9.3 (SAS Institute, Cary, Caroline du Nord, États-Unis).

Les pays différaient les uns des autres lors de l'examen de la prévalence de TBHP de l'animal, et pour plusieurs combinaisons TBHP-pays, une variation saisonnière significative a également été observée (voir le tableau 2 pour les comparaisons par paires entre les pays et les visites, et la figure 2 pour un aperçu macro-géographique). Anaplasma marginale était de loin le pathogène le plus répandu, le Ghana ayant la prévalence la plus élevée (92,1 à 100%). Le congénère A. centrale était moins répandu (< 5%) sur tout le continent. La prévalence d'Ehrlichia ruminantium variait entre 3,4% (Burkina Faso) et 18% (Bénin). Babesia bigemina a été observée en nombre relativement élevé (> 10 %), sauf en Ouganda (< 10 %) et au Burkina Faso (1,0 %). En revanche, le congénère B. bovis a été trouvé dans moins de 10 % des bovins pour tous les pays, et était absent en Éthiopie.

Variation macro-géographique de la prévalence des agents pathogènes. Des moyennes globales (+ 1 écart-type) sont calculées sur les différentes exploitations (imbriquées dans le district). BF Burkina Faso, GH Ghana, BN Bénin, NG Nigéria, ET Éthiopie, UG Ouganda, TZ Tanzanie

Une partie de la variation de la prévalence du TBHP s'expliquait par les contrastes individuels des charges d'infestation de tiques vecteur-compétentes (gamme Logit au niveau individuel : 1,48–3,72 10–3 ; tous les P < 0,041 ; tableau 3), à l'exception de B. bigemina. Pour la prévalence d'A. marginale, les charges d'infestation locales moyennes (c'est-à-dire au niveau de l'exploitation) ont également montré une corrélation positive (Logit : 5,73 ± 2,38 10–3 ; t(247,8) = 2,41 ; P = 0,017). Les bovins des troupeaux transhumains avaient tendance à avoir une prévalence plus élevée d'A. marginale que les bovins communautaires (Logitlrans—communal : 0,83 ± 0,21 ; t(1256) = 4,06 ; P < 0,0001). Les bovins femelles avaient tendance à montrer des prévalences d'Ehrlichia plus faibles que les mâles (Logit femelle-mâle : − 0,20 ± 0,09 ; t(5872) = − 2,27 ; P = 0,024).

Pour plusieurs agents pathogènes, des effets du poids corporel (une approximation de l'âge de l'animal) ont été observés, bien que dans des directions opposées : tandis que les prévalences d'A. marginale ont montré une association positive (logit au niveau individuel : 8,83 ± 0,68 10–3/kg ; t(5726) = 12,99 ; P < 0,001), à la fois B. bigemina (niveau individuel Logit : − 2,46 ± 0,85 10–3/kg ; t(5781) = − 2,90 ; P = 0,0038) et E. ruminantium (niveau individuel Logit : − 4,27 ± 1,1 10–3/kg ; t(5805) = − 3,86 ; P = 0,0001 ; logit au niveau de l'exploitation : − 7,76 ± 2,87 10–3/kg ; t(313,4) = − 2,70 ; P = 0,0073) ont montré des associations négatives. De plus, les prévalences de Babesia bovis étaient négativement corrélées avec l'état corporel (un indicateur de l'effet de production) tant au niveau individuel (logit : − 0,14 ± 0,05 ; t(5199) = − 2,61 ; P = 0,009) qu'au niveau local (logit : − 0,57 ± 0,20 ; t(164,6) = − 2,82 ; P = 0,005) qui est également représenté par les résidus partiels de la figure 3.

Résidus partiels de Pearson des prévalences de Babesia bovis (obtenus à partir du modèle mixte linéaire généralisé) tracés en fonction de l'état corporel (moyenne par ferme, moyenne centrée dans le district). La taille des bulles correspond au nombre de vaches échantillonnées dans chaque ferme. À des fins d'illustration, des courbes linéaires (a*x) ont été ajoutées sur la base de l'approximation des moindres carrés. Les couleurs correspondent à l'un des 14 quartiers

Lors de l'application des critères établis en amont (voir la section 'Analyse statistique'), uniquement pour les Babesia spp. le rôle potentiel de vecteur de tiques supplémentaires pourrait être testé. Ici, la variation individuelle des charges de Hyalomma rufipes était positivement associée à la prévalence de B. bigemina (logit 19,13 ± 8,7 10–3 ; P = 0,028). D'autres espèces de tiques étaient négativement associées à la prévalence du TBHP (par exemple, Rhipicephalus pulchellus au niveau du district) ou n'avaient aucune corrélation.

Après correction des facteurs de risque extrinsèques et intrinsèques au niveau individuel (tableau 3), certaines combinaisons d'agents pathogènes se sont produites plus souvent que prévu par hasard. Comme indiqué par le modèle exploratoire HMSC (Fichier supplémentaire 1 : Fig. S1), les bovins étaient plus souvent infectés par B. bigemina lorsqu'ils étaient infectés par E. ruminantium (logityes-no : 0,39 ± 0,12 ; t(5855) = 3,30 ; P = 0,001 ). En revanche, les bovins étaient moins souvent infectés par B. bigemina lorsqu'ils étaient infectés par A. marginale (logityes-no : − 0,47 ± 0,03 ; t(5724) = − 5,30 ; P < 0,0001).

L'objectif principal de l'étude était de déterminer les TBHP bovins les plus importants dans sept pays d'Afrique subsaharienne (tableau 2) et de documenter les facteurs de risque potentiels d'infection à TBHP. Nous avons guidé la collecte des données via un protocole rigoureux prédéfini, ainsi fait une analyse sur des données standardisées. Notre étude incarne donc un statut relativement à jour des TBHP bovins dans les systèmes d'élevage rural à petite échelle. De plus, en respectant la structure hiérarchique des données dans nos analyses, nous avons pu investiguer les associations au niveau individuel, qui est le moins affecté par les biais écologiques.

Plus de 70 % des animaux prélevés étaient infectés par au moins un TBHP. Alors que plusieurs TBHP se sont produits à des prévalences élevées (Anaplasma marginale) à moyennes (Babesia bigemina et Ehrlichia ruminantium) - dont la plupart présentaient également une variation spatiale significative - Theileria parva était presque absente de tous les sites échantillonnés. Une explication possible de cette dernière observation est la forte mortalité causée par la fièvre de la côte orientale dans les zones où le vecteur R. appendiculatus est présent (Ouganda et Tanzanie), en particulier chez les animaux jeunes et sensibles [4]. Seuls les animaux gravement infectés et/ou porteurs peuvent être trouvés positifs, mais, en particulier pour ce dernier groupe, la sensibilité des méthodes de diagnostic est souvent trop faible pour détecter les antigènes circulants.

Sans avoir aucune connaissance approfondie de l'abondance et de la diversité des hôtes locaux, plusieurs des modèles géographiques s'avèrent être la conséquence de la biologie des tiques, en particulier leur compétence vectorielle et leur présence. La variation macro-géographique d'une espèce de tique, Hyalomma rufipes, a coïncidé avec la présence de B. bovis dans le sang de l'animal. Bien que cette tique n'ait pas été considérée comme vecteur compétente pour cette espèce de Babesia, elle s'avère l'être pour Babesia occultans [24]. Étant donné que H. rufipes ne partage pas les mêmes niches écologiques que les tiques Rhipicephalus compétentes pour Babesia bovis, des recherches supplémentaires sur son lien avec l'agent pathogène sont nécessaires. L'élevage a joué un rôle dans A. marginale, dans la mesure où les bovins d'élevage en transhumance étaient plus souvent infectés que les animaux communautaires. Cette différence peut être le résultat de risques d'exposition plus élevés aux tiques et aux mouches des grands herbivores sauvages du premier groupe. Parmi les facteurs de risque d'exposition intrinsèques, le sexe de l'animal expliquait une partie de la variation de la prévalence d'E. ruminantium, les femelles ayant des prévalences significativement plus faibles que les mâles. Les effets immunosuppresseurs des androïdes, qui augmenteraient la sensibilité aux tiques et/ou au TBHP, pourraient être à la base physiologique de cette observation, en plus de facteurs comportementaux comme les différences sexuelles dans l'itinérance et le toilettage [13]. Des effets contrastés avec le poids corporel - un indicateur de l'âge du bétail - ont également été trouvés : chez A. marginale, le poids corporel était positivement associé, ce qui pourrait être l'effet du risque d'exposition cumulé avec l'âge et/ou une tolérance plus élevée aux agents pathogènes chez l'animal le plus lourd. Alternativement, comme l'anaplasmose bovine entraîne une réduction du gain de poids et que les animaux récupérés nécessitent une longue période de convalescence au cours de laquelle ils sont moins productifs [6], une mortalité plus élevée chez les animaux plus légers a conduit à l'association positive observée avec le poids corporel. En revanche, chez les E. ruminantium et B. bigemina plus virulents, le poids corporel était négativement associé à la prévalence de l'agent pathogène, ce qui pourrait être l'effet de l'immunité acquise (plus susceptible de se développer avec l'âge) et du statut de porteur de l'animal, des niveaux plus élevés de résistance chez les animaux plus lourds et/ou taux de survie affectés par les agents pathogènes. Sans expériences, il est difficile d'exclure des interprétations alternatives comme les différences d'exposition liées à l'âge ou la résistance innée [13].

La prévalence la plus élevée de B. bovis était liée aux animaux avec le score d'état corporel le plus bas, confirmant les niveaux de pathogénicité élevés qui accompagnent cet agent pathogène et/ou une sensibilité plus élevée chez les animaux de conditions inférieures, entraînant inévitablement des pertes de production importantes. C'est la première fois que l'effet de la prévalence de B. bovis sur le score d'état corporel a été évalué à l'aide d'une méthode uniforme et standardisée sur une zone géographique aussi vaste. Compte tenu de la propagation sans cesse croissante de R. microplus (le vecteur le plus important de B. bovis) en Afrique de l'Ouest [25] et de l'Est [2] mais aussi dans d'autres régions subtropicales et tropicales du globe, les pertes de production pourraient rester sous-estimées et donc aussi l'importance du contrôle des tiques. Comme cette tique monotrope à hôte unique a développé des souches résistantes sur plusieurs continents à différentes classes d'acaricides [26], elle reste la menace acarologique la plus importante pour le bétail dans le monde. Les autres TBHP n'ont montré aucune association avec les scores d'état corporel, ce qui peut être dû à un certain niveau de stabilité endémique et au statut de porteur. Cependant, tant que le R0 de Babesia bovis - qui est inévitablement lié à la biologie et à l'histoire de vie des tiques et de l'hôte [27] ainsi qu'aux interactions synergiques/antagonistes avec les parasites co-infectants - est suffisamment grand, l'agent pathogène peut prospérer sans besoin de réduire la virulence [28].

L'une des limites de cette étude observationnelle est la différenciation entre la corrélation et la causalité dans les associations susmentionnées entre la présence de TBHP et les mesures de santé générales du bétail. L'évaluation de la pathologie (par exemple, l'anémie, l'ictère) aiderait à mieux comprendre si les signaux positifs à la PCR sont liés à des dommages plus spécifiques à l'agent pathogène, et se traduirait donc également par une meilleure évaluation des impacts socio-économiques locaux par les TBHP. En l'absence de données longitudinales expérimentales - en contrôlant les facteurs de stress écologiques affectant la santé de l'animal - la cause et la conséquence dans les observations qui incluent des troubles de la santé sont difficiles à démêler.

Les co-infections trouvées chez les individus suggèrent fortement que les bovins sont permissifs pour de multiples agents pathogènes. La co-infection observée la plus fréquente était A. marginale × B. bigemina, mais aussi A. marginale × E. ruminantium a été fréquemment observée. L'apparition de B. bigemina était plus probable lorsque E. ruminantium était présent dans le sang, c'est-à-dire que cette combinaison était beaucoup plus élevée que prévu d'après la prévalence de chaque agent pathogène séparément. Cela pourrait être le résultat d'une variation de la sensibilité générale chez les animaux individuels, mais pourrait également indiquer une facilitation de la transmission et/ou de la prolifération entre deux agents pathogènes. Babesia bigemina était moins susceptible d'être trouvée lorsque l'animal était infecté par A. marginale. L'immunité croisée est peu probable étant donné que les deux agents pathogènes ont des répertoires d'antigènes différents, mais une préparation immunitaire plus élevée causée par l'infection par un TBHP pourrait entraîner une sensibilité plus faible envers l'autre TBHP [29]. Les voies qui conduisent à la facilitation et/ou à l'inhibition ne peuvent être élucidées que par des études expérimentales dans lesquelles les interactions physiologiques, cellulaires et biochimiques induites par les parasites sont démêlées [30, 31].

Cette surveillance standardisée souligne l'importance des agents pathogènes du bétail transmis par les tiques en Afrique subsaharienne, le co-parasitisme étant la règle plutôt que l'exception. Les études futures pourraient également inclure des enquêtes sur les hôtes fauniques, les densités de tiques dans l'environnement hors hôte, les caractéristiques détaillées de l'habitat et les ressources spécifiques susceptibles de soutenir des populations denses de tiques et donc la circulation des TBHP. Des isolats de souches de parasites pertinentes doivent être évalués pour l'efficacité de différents produits pharmaceutiques et biologiques, ce qui peut entraîner des stratégies de contrôle plus efficaces. Étant donné que les mouvements transfrontaliers de bétail entre les pays africains sont un facteur de risque majeur dans la gestion des maladies à transmission vectorielle en Afrique, les études génétiques sur la population des souches pertinentes peuvent également fournir des informations supplémentaires sur la propagation et l'invasion des TBHP. L'intégration de ces connaissances avec une bonne compréhension des complexités actuelles des changements socio-économiques et climatiques permettra aux décideurs politiques et aux scientifiques de proposer des stratégies de prévention.

Les ensembles de données générés et/ou analysés au cours de l'étude actuelle ne sont pas accessibles au public en raison d'accords d'organisation de recherche sous contrat (les données seront stockées dans les archives de Clinglobal, Maurice), mais sont disponibles auprès de l'auteur correspondant sur demande raisonnable.

Acide désoxyribonucléique

Modèle mixte linéaire généralisé

Réaction en chaîne par polymérase quantitative en temps réel

Jahnke H. Systèmes de production animale et développement de l'élevage en Afrique tropicale, vol. 35. Kiel : Kieler Wissenschaftsverlag Vauk ; 1982

Google Scholar

Muhanguzi D, Byaruhanga J, Knowledge W, Ndekezi C, Ochwo S, Nkamwesiga J, et al. Tiques bovines invasives en Afrique de l'Est : confirmation morphologique et moléculaire de la présence de Rhipicephalus microplus dans le sud-est de l'Ouganda. Vecteurs parasites. 2020;13:1–9

Article Google Scholar

Riggio V, Tijjani A, Callaby R, Talent A, Wragg D, Obishakin ET, et al. Évaluation des performances de la matrice de génotypage pour les études d'association à l'échelle du génome et l'imputation chez les bovins africains. Gènes Cell Evol. Rév. 2022 ;54 : 1–2

Article Google Scholar

Coetzer JAW, Tustin RC. Maladies infectieuses du bétail. Presse universitaire d'Oxford; 2005.

Google Scholar

Allsopp BA. Histoire naturelle d'Ehrlichia ruminantium. Vétérinaire Parasitol. 2010;167:123–35.

Article CAS PubMed Google Scholar

[ PubMed ] Kocan KM, De la Fountain J, Blouin EF, Coetzee JF, Ewing SA. L'histoire naturelle d'Anaplasma marginale. Vétérinaire Parasitol. 2010;167:95–107.

Article CAS PubMed Google Scholar

Bock R, Jackson L, De Vos A, Jorgensen W. Babésiose du bétail. Parasitologie. 2004;129:S247–69.

Article PubMed Google Scholar

Nene V, Kiara H, Lacasta A, Pelle R, Svitek N, Steinaa L. La biologie de Theileria parva et le contrôle de la fièvre de la côte Est - état actuel et tendances futures. Tiques Cochez Borne Dis. 2016;7:549–64.

Article PubMed Google Scholar

Norval R, Perry B, Young A. L'épidémiologie de la theilériose en Afrique. Londres : Academic Press ; 1992.

Google Scholar

Gachohi J, Skilton R, Hansen F, Ngumi P, Kitala P. Épidémiologie de la fièvre de la côte Est (infection à Theileria parva) au Kenya : passé, présent et futur. Vecteurs parasites. 2012;5:1–3.

Article Google Scholar

Altizer S, Dobson A, Hosseini P, Hudson P, Pascual M, Rohani P. Saisonnalité et dynamique des maladies infectieuses. Écol Lett. 2006;9:467–84.

Article PubMed Google Scholar

Randolph SE, Chemini C, Furlanello C, Genchi C, Hails RS, Hudson PJ, et al. L'écologie des infections transmises par les tiques dans les réservoirs de la faune. Dans : Hudson PJ, Dobson AP, Grenfell BT, Heesterbeek H, Dobson AP, éditeurs., et al., L'écologie des maladies de la faune. Oxford : presse universitaire d'Oxford ; 2002. p. 119–38.

Google Scholar

Wilson K, Bjornstad ON, Dobson AP, Merler S, Poglayen G, Randolph SE, et al. Hétérogénéités dans les infections à macroparasites : modèles et processus. Dans : Hudson PJ, Grenfell BT, Heesterbeek H, Dobson AP, éditeurs., et al., L'écologie des maladies de la faune. Oxford : presse universitaire d'Oxford ; 2002. p. 6–62.

Google Scholar

Papli N, Landt O, Fleischer C, Koekemoer JO, Mans BJ, Pienaar R, et al. Évaluation d'une PCR en temps réel TaqMan pour la détection de Theileria parva chez les buffles et les bovins. Vétérinaire Parasitol. 2011;175:356–9.

Article CAS PubMed Google Scholar

Steyn HC, Pretorius A, McCrindle CME, Steinmann CML, Van Kleef M. Un test PCR quantitatif en temps réel pour Ehrlichia ruminantium utilisant pCS20. Microbiol vétérinaire. 2008;131:258–65.

Article CAS PubMed Google Scholar

Kim C, Iseki H, Herbas MS, Yokoyama N, Suzuki H, Xuan X, et al. Développement de tests PCR en temps réel basés sur TaqMan pour la détection diagnostique de Babesia bovis et Babesia bigemina. Am J Trop Med Hyg. 2007;77:837–41.

Article CAS PubMed Google Scholar

Decaro N, Carelli G, Lorusso E, Lucente MS, Greco G, Lorusso A, et al. Réaction en chaîne par polymérase duplex en temps réel pour la détection et la quantification simultanées d'Anaplasma marginale et d'Anaplasma centrale. J Vet Diagn Invest. 2008;20:606–11.

Article PubMed Google Scholar

Walker AR, Bouattour A, Camicas JL, Estrada-Peña A, Horak IG, Latif AA, et al. Les tiques des animaux domestiques en Afrique : guide d'identification des espèces. Édimbourg : Rapports sur les biosciences ; 2003.

Google Scholar

Garance M : clé d'identification. 2012a. https://www.ispotnature.org/webkeys/keyintroduction.jsp?selectedKey=webkeys/Rhipicephalus%28Boophilus%29_females.0.1.

Garance M : clé d'identification. 2012b. https://www.ispotnature.org/webkeys/keyintroduction.jsp?selectedKey=webkeys/Rhipicephalus(Boophilus)_males.0.2.

Molenberghs G, Verbeke G. Modèles pour données longitudinales discrètes. Berlin-Heidelberg-New York : Springer ; 2005.

Google Scholar

Steyerberg EW. Modèles de prédiction clinique : une approche pratique du développement, de la validation et de la mise à jour. New York : Springer ; 2009.

Réserver Google Scholar

Tikhonov G, Opedal OH, Abrego N, Lehikoinen A, de Jonge MMJ, Oksanen J, et al. Modélisation conjointe de la distribution des espèces avec le r-package Hmsc. Méthodes Ecol Evol. Rév. 2020;11:442–7

Article PubMed PubMed Central Google Scholar

Gray JS, Devos AJ. Études sur une Babesia bovine transmise par Hyalomma marginatum rufipes Koch, 1844. Onderstepoort J Vet Res. 1981;48:215–23.

CAS PubMed Google Scholar

Garance M, Thys E, Achi L, Touré A, De Deken R. Rhipicephalus (Boophilus) microplus : une espèce de tique envahissante la plus réussie en Afrique de l'Ouest. Exp Appl Acarol. 2011;53:139–45.

Article CAS PubMed Google Scholar

Dzemo WD, Thekisoe O, Vudriko P. Développement de la résistance aux acaricides dans les populations de tiques de bovins : une revue systématique et une méta-analyse. Hellion. 2022;8:1–1

Article CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Heylen DJA, Matthysen E. Virulence différentielle chez deux tiques congénères infestant des oisillons d'oiseaux chanteurs. Parasitologie. 2011;138:1011–21.

Article PubMed Google Scholar

Cressler CE, McLeod DV, Rozins C, van den Hoogen J, Day T. L'évolution adaptative de la virulence : un examen des prédictions théoriques et des tests empiriques. Parasitologie. 2016;143:915–30.

Article PubMed Google Scholar

Henrichs B, Oosthuizen MC, Troskie M, Gorsich E, Gondhalekar C, Beechler BR, et al. L'influence des co-infections au sein de la guilde sur l'appartenance à la communauté parasitaire : une étude longitudinale chez le buffle d'Afrique. J Animal Ecol. 2016;85:1025–34.

Article PubMed Google Scholar

Graham AL. Règles écologiques régissant la coinfection helminthes-microparasites. Proc Natl Acad Sci USA. 2008;105:566–70.

Article CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Heylen DJA, Reinoso-Perez MT, Goodman L, Dhondt KV, Dhondt AA. Ectoparasitisme lors d'une épidémie de maladie aviaire : une expérience avec des roselins et des tiques infectés par Mycoplasma. Int J Parasitol Parasites Faune. 2020;12:53–63.

Article Google Scholar

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Les auteurs tiennent à remercier les institutions, les collaborateurs, leur personnel et les agriculteurs sans qui la réalisation de cette enquête n'aurait pas été possible, notamment : Dr Dinka Ayana - Le meilleur de Dinka Ayana Teshale Sori (tous deux de l'Université d'Addis-Abeba) ; Dr Jahashi Nzalawahe (Université d'agriculture de Sokoine) et Dr. Emmanuel Swai (Ministère du développement de l'élevage et de la pêche) ; Dr Charles Waiswa (Conseil ougandais de contrôle de la trypanosomiase) ; Dr Amonya Collins (officier vétérinaire de district, district de Serere); Bigirwa Godfrey, Stephen Kakooza, Dr. Bière Johnson, Dr. Dr Omaido Edward, Gloria Grace Akurut et Dr. Akech Olivia, Dr. Touré Alassane, Dr. Vitouley Hervé, Techniciens Zoungrana Sébastien, Zoungrana Adrien (Centre international de recherche en Afrique).

L'étude a été financée par la Fondation Bill & Melinda Gates (BMGF) (Grant OPP1125367).

Groupe d'écologie évolutive, Département de biologie, Université d'Anvers, Wilrijk, Belgique

Dieter J.A. Heylen

Groupe d'éco-épidémiologie, Département des sciences biomédicales, Institut de médecine tropicale, Anvers, Belgique

Dieter J.A. Heylen

Institut interuniversitaire de biostatistique et de bioinformatique statistique, Université de Hasselt, Diepenbeek, Belgique

Dieter J.A. Heylen

Département de parasitologie, Collège de médecine vétérinaire et d'agriculture, Université d'Addis-Abeba, Bishoftu, Éthiopie

Bersissa Kumsa

Département de microbiologie vétérinaire et de parasitologie, Collège de médecine vétérinaire et des sciences biomédicales, Université d'agriculture de Sokoine, PO Box 3019, Morogoro, Tanzanie

Elikira Kimbita

Département des ressources biomoléculaires et des sciences biolaboratoires (BBS), Collège de médecine vétérinaire, Université Makerere, Kampala, Ouganda

Frère Nobert Frank & Dennis

Département des maladies tropicales vétérinaires, Faculté des sciences vétérinaires, Université de Pretoria, Onderstepoort, Afrique du Sud

François Jongejan

Laboratoire de Recherches Zootechniques, Vétérinaires et Halieutiques (LRZVH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRAB), 01 BP 884, Cotonou, Bénin

Safiou Bienvenu Adehan

Université Nangui Abrogoua, UFR Sciences de La Nature, 02 Bp 801, Abidjan 02, Côte d’Ivoire

Alassane Touré

Département de biologie animale et des sciences de la conservation, École des sciences biologiques, Collège des sciences fondamentales et appliquées, Université du Ghana, Legon-Accra, Ghana

Fred Aboagye-Mouton

Institut national de recherche vétérinaire, Vom, État du Plateau, Nigéria

Chef Isaac Ogo

Fondation Bill & Melinda Gates, Seattle, WA, États-Unis

Nick Juleff

Clinvet International Pty (Ltd), 1479 Talmadge Hill South, Waverly, NY, 14892, États-Unis

Dionne Crafford et Josèphe Fourie

Clinique, Bloemfontein, Afrique du Sud

Michel Labuchange

Clinglobal, B03/04, The Tamarin Commercial Hub, Jacaranda Avenue, Tamarin, 90903, Maurice

Maxime Garance

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BK, EK, MD, FJ, AT, FAA, NIO, DC, JF, DJAH & MM ont conçu et conçu l'étude. BK, EK, MNF, MD, FJ, SBA, AT, FAA, NIO, DC, JF, ML, MM ont prélevé des échantillons de sang de bovins. DJAH, GF, NJ, DC, JF, ML, MM ont analysé des échantillons de sang de bovins pour différents TBHP. DJAH, GF, BK, NJ, DC, JF, ML, MM ; rédigé le manuscrit initial. Tous les auteurs ont examiné et approuvé de manière critique le manuscrit final. DJAH a analysé les données et a rédigé le premier projet avec MM. Tous les autres auteurs ont apporté une contribution scientifique substantielle à la version finale du manuscrit. Tous les auteurs ont lu et approuvé le manuscrit final.

Correspondance avec Dieter JA Heylen.

Il s'agissait d'une enquête sur les parasites sans intervention expérimentale. En tant que telles, les circonstances respectaient les Principes directeurs internationaux pour la recherche biomédicale impliquant des animaux (Conseil des organisations internationales des sciences médicales). L'approbation pour mener l'étude a été obtenue auprès des comités institutionnels de protection et d'utilisation des animaux (IACUC). Les approbations pour mener l'étude en Ouganda ont été obtenues auprès du comité d'éthique de la recherche de l'École de biosécurité, de biotechnologie et de sciences de laboratoire de l'Université de Makerere [numéro d'approbation ; SBLS/REC/16/135] et le Conseil national ougandais pour la science et la technologie [numéro d'approbation A 513].

N'est pas applicable.

L'enquête a été financée par la Fondation Bill & Melinda Gates (BMGF) (Grant OPP1125367) dont NJ était un représentant. Le commanditaire n'a pas dicté la conception de l'étude (mais a examiné et approuvé le protocole) et n'a pas été impliqué dans la collecte, l'analyse ou l'interprétation des données (mais a examiné et approuvé le rapport). Clinvet/Clinglobal a été engagé (projet n° CV16/337) pour effectuer l'enquête, et au moment de la réalisation, JF était employé par Clinvet, et FJ, MM et DC étaient employés par Clinglobal. BK, EK et MD ont été engagés par JF pour agir en tant qu'enquêteurs dans les pays respectifs d'Afrique de l'Est.

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Contrôles positifs synthétiques. Tableau S1. Tiques vecteurs compétentes pour les quatre agents pathogènes transmis par les tiques couverts par l'analyse écologique. Tableau S2. Répartition des (co-)infections chez les bovins. Figure S1. Carte thermique des associations d'espèces à espèces de TBHP (co-infections) basée sur les modèles HMSC.

Protocole.

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Réimpressions et autorisations

Heylen, DJA, Kumsa, B., Kimbita, E. et al. Agents pathogènes transmis par les tiques et état corporel du bétail dans les systèmes de production animale rurale des petits exploitants en Afrique de l'Est et de l'Ouest. Vecteurs parasites 16, 117 (2023). https://doi.org/10.1186/s13071-023-05709-0

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Reçu : 28 novembre 2022

Accepté : 18 février 2023

Publié: 30 mars 2023

DOI : https://doi.org/10.1186/s13071-023-05709-0

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